Il semble bien qu'à sa nomination, l'abbé de Bone n'approuva pas le versement de la moitié des bénéfices de Montoulieu, à l'évêque Simon de Beausole, ancien abbé. Il fut excommunié par l'official de Saint-Papoul, chargé des intérêts de Simon de Beausole.
Une bulle du pape Léon X en date du XVIIème des Calendes de février 1519 (1520 n. st.) commettait plusieurs prélats à l'effet de lever cette excommunication après enquête, contre promesse de paiement des sommes injustement retenues par Sébastien de Bone.
Les 28 et 29 octobre 1520, l'abbé Sébastien nommait pour toutes les terres de son obédience: - Viguier, Noble N. de la Roche, (de Rupe) Chevalier, avec pouvoir de faire et de rendre justice; - Juge, Pierre de Grassalio, Docteur en droit; - lieutenant du Viguier, Barthélemy de Satger, viguier royal de Montolieu.
Sébastien de Bone se démit en 1540 de son titre d'abbé, en faveur de son neveu, avec lequel il permuta de l'agrément du roi pour l'office de camérier de l'abbaye.